Nature Communications丨AI 三维行为分析+光遗传“双剑合璧”:破解帕金森病行为密码!

帕金森病(PD)是一种全球流行的神经退行性疾病,以经典“运动四重奏”——震颤、僵直、运动迟缓、姿势不稳——为主要症状。研究者们利用小鼠模型来研究 PD 的发病机制和评估潜在的治疗方法,但传统的行为评估方法往往过于简化,无法全面捕捉 PD 的复杂症状,这限制了对疾病进展和治疗反应的深入理解。

面对“机制不清、疗效不稳、评估不准”的难题,2025 年 8 月 21 日,韩国科学技术院(KAIST)生命科学系 Won Do Heo 团队与哈佛医学院 McLean 医院在《Nature Communications》发表了题为“Integrating artificial intelligence and optogenetics for Parkinson’s disease diagnosis and therapeutics in male mice”的研究论文。研究团队展示了将人工智能(AI)与光遗传学(称为 optoRET )干预相结合,能够在自由活动的雄性 AAV-hA53T 小鼠中实现广泛的行为评估,提供了一种高效的诊断方法,并为帕金森病的创新治疗策略奠定了基础。


该研究介绍了 3D 姿态估计系统,该系统能够通过 5 个视角录像捕捉小鼠的运动,并利用深度学习模型来解析其行为,与二元分类模型和可解释的人工智能相结合,能够比传统方法更早、更准确地检测出帕金森病的严重程度组别,并确定了一整套帕金森病的行为标志物,包括步态和频谱时间特征。此外,他们还引入了一种名为 optoRET 的光遗传工具,通过蓝光开关控制 c-RET 信号通路的方法,改善了帕金森小鼠肢体协调和运动能力以及减少胸部震颤,有效减缓了帕金森病的进展。通过一系列行为测试和组织学分析,研究团队评估了 PD 模型小鼠的运动功能障碍,并验证了 optoRET 在减轻 PD 症状方面的有效性,为未来的诊断和治疗策略提供了新的视角。

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帕金森小鼠模型的建立与评估

研究者们利用病毒介导的 α-synuclein 过表达,通过在 B6J 雄性老鼠双侧 SNc 递送 hA53T-αSyn ,成功诱导了剂量依赖性的 PD 症状和病理变化(图1a)。实验分为对照组(CT)以及帕金森病组(PD), PD 组中低剂量(A1)与高剂量(A5)分别对应轻度与重度病程(图1b)。为了评估运动功能障碍,研究者们进行了行为测试。十周病程追踪显示,随着时间的推移, PD 组小鼠运动功能障碍逐渐恶化,并呈现剂量递增,到 10 周时与 EV 组相比变化显著。 A5 组的旋转杆测试评分(RRS)下降幅度比 A1 组更显著,且两组 PD 小鼠的高架梁行走测试评分(BWS)存在显著差异(图1c-f)。另外,组织学分析显示,两组 PD 小鼠的纹状体 TH 纤维密度和黑质多巴胺能神经元数量均显著下降。 A5 组与 A1 组相比,细胞丢失更为严重(多 26%)(图1g-h)。

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AI驱动的帕金森诊断

为了克服传统行为评估方法的局限性,研究者们采用了基于 AI 的三维姿态估计技术,从旷场测试的视频记录中检测小鼠身体的关键节点,重建小鼠的三维运动序列。利用机器学习(ML)框架 PyCaret ,研究者们开发了基于 XGBoost(XGB) 模型的 AI 诊断系统,能够以 90% 的准确率区分 PD 和非 PD 小鼠(图1i-j)。 XGB 模型将每个运动片段分类为非 PD(NP)或 PD ,并计算每个小鼠 PD 片段的比例,作为 AI 预测的 PD 评分(APS), APS 在区分 PD 严重程度方面表现出更高的敏感性,并且能够在早期(术后 2 周)检测到 PD(图1k-l)。

为了评估 APS 对 PD 的特异性,研究者们评估了 SOD1-G93A ALS 模型小鼠。尽管 ALS 组表现出显著的运动功能障碍,但其 APS 保持较低水平。这支持了 APS 反映的是 PD 特异性病理,而非一般的运动缺陷

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AI识别帕金森病小鼠的关键行为特征

为了深入了解 hA53T 帕金森病(PD)小鼠的行为特征,研究者们采用了一种可解释的 AI 技术 TreeExplainer 来解释 XGB 模型的决策过程。通过 SHapley Additive exPlanations(SHAP)值,研究者们量化了每个特征对 PD 预测的影响,并识别了对预测影响最大的 20 个特征(图2a)。通过对这 20 个特征分析,研究者们总结了 PD 小鼠的关键行为特征(图2b):

1.肢体运动协调性受损。 XGB 模型将与手和脚相关的特征列为 PD 诊断的关键因素,其中一半的特征与肢体运动相关。与 CT 小鼠相比, PD 小鼠表现出明显的肢体间不对称性,手部活动受限,站姿更宽的特征。

2.运动和姿势平衡改变。 长期分析显示, PD 组(A5)的运动持续时间逐渐增加,而对照组(CT)的运动间隔随时间增加,这可能反映了 CT 组对重复暴露于相同环境的适应性,而这种适应性在 PD 组中缺失。 PD 小鼠的胸部垂直速度显著低于 CT 小鼠,由于高速垂直运动通常与小鼠的饲养行为相关,这一发现提示 PD 小鼠可能表现出更慢或更缓慢的垂直运动,可能说明姿势失衡。

3.核心身体区域的僵硬增加。 PD 小鼠的身体姿势更僵硬(最小身体 2D 长度增加)和更弯曲(最小身体角度增加)。此外, PD 小鼠颈部运动动力学模式中在病程中经历了转变,呈现先增加后减少的趋势,这反映了疾病进展。

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光遗传学减轻帕金森小鼠的疾病进展

鉴于 c-RET 的复杂性及其作为 PD 治疗靶点的潜力,研究者们推出了一种被称为 optoRET 的基因编码光遗传学工具,并在 aSyn PD 小鼠模型中研究了 optoRET 的治疗效果,旨在确定是否选择性和时间控制的 c-RET 信号调节可以作为常规 GDNF 疗法的可行替代方案。

研究者们将 AAV-DJ / 8-hSyn1-DIO-optoRET 和 hA53T 共注射到小鼠大脑的黑质致密部(SNc),随后进行行为评估。利用行为神经科学无线网络(WNBN)系统将 optoRET 激活与蓝光偶联,实现定时光暴露(每日、每两周和隔日激活)(图3a)。

APS 评分显示, optoRET 激活对 A5 小鼠的病程缓解无效,但在 A1 小鼠中,每两周(A1O2)和隔日(A1O3)激活显著抑制了 PD 进展。 A1O2 和 A1O3 组均没有发现重度 PD 小鼠(图3b),且 A1O3 组与对照组(EV)相比无显著差异,但 APS 显著低于未处理的 A1 组(图3c)。另外,组织学分析表明, A1O3 组显著减轻了 A1 小鼠的纹状体 TH 纤维密度和黑质 DA 神经元数量较少的病理征状(图3d-e)。

与持续给药不同, optoRET 疗效仅在特定的 c-RET 信号激活策略下才显现出来,这一发现可能强调了间断但重复激活 RET 信号是一种更有效的治疗方式,这一发现可能表明细化治疗方案对于提升治疗效果至关重要。

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光遗传学改善肢体协调性

通过在 A1O3 组中进行了治疗反应评估(TRE)(图3f),研究者们发现,在 A1O3 组中, 65% 的特征得到改善。在治疗特征的 PD 症状评估(PSE)中,协调性的改善,尤其是手部运动的改善最为显著。这些结果表明 optoRET 光激活对轻度 hA53T PD 小鼠的运动功能有益,尤其是通过增强肢体协调。

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光遗传学改善PD小鼠的光谱特征

为了弥补行为评估在光谱特征方面的缺失,研究者们利用时间序列特征提取库(TSFEL)进行光谱-时间域分析(图4a), 将运动序列分割成 4 秒的长片段,每个片段提取 4485 个特征,使用与 XGB 模型类似的机器学习流程,开发了 TSFEL 模型。该模型在验证数据集上达到了 90% 的准确率,预测结果与 XGB 模型一致。

在 TRE 结果中, A1O3 组 55% 的特征得到改善。在特征域评估中,与胸部相关特征的改善尤为明显,这表明 optoRET 在改善胸部运动的光谱方面有显著效果(图4b)。此外,通过 SHAP 分析,发现 PD 组的胸部运动幅度变化更大,胸部运动频率显著增加,接近人类 PD 患者的震颤频率范围,但治疗组的频率增加不显著,表明 optoRET 治疗可能对震颤发展有调节作用(图4c-f)。类似地, optoRET 治疗也在一定程度上改善 PD 小鼠的颈部运动和尾部运动障碍(图4g-l)。

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光遗传学改善 PD 小鼠的转向、直立行为和步态

为了增强对 PD 表型相关行为特征的理解,并进一步验证光遗传学工具 optoRET 的治疗效果,研究者们在片段中注释了转向、直立和行走行为,并从中提取特征(图5a)。**转向和直立行为在 PD 组中显著受到影响。**在转向行为中 A5 组转向持续时间增加, A1 和 A5 组转向速度降低,但 A1O3 组与对照组无显著差异(图5c-d)。在直立行为中, PD 组在直立过程中的胸部垂直速度变化更大, A5 组在直立转换阶段的速度峰值显著降低(图5e-f)。

行走行为中,小鼠的步态特征也是评估 PD 的重要指标,基于 AI 排序的前 20 个特征(图5h),研究者们应用了 PD 步态分类模型,计算每只小鼠的 PD- 特征步数占总步数的比例作为 PD 步态评分, PD 步态评分预测与 PD 分组结果一致(图5g)。为了验证 optoRET 在步态方面的改善效果,研究者们采用与之前类似的评估方式,发现 60% 的步态特征在 A1O3 组中得到改善,未治疗的特征主要与空间领域相关,尤其是姿势成分(图5i)。通过热图分析,研究者们发现 PD 组的脚部拖曳显著增加,而这一现象在 A1O3 组中得到显著改善(图5j-l)。这些结果表明, optoRET 显著改善了帕金森病患者的步态,特别是防止足部拖后。

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总结

在这项研究中,研究团队建立了人工智能的 PD 诊断和光遗传方法作为治疗策略。在 PD 诊断方面, XGB 模型达到了 90% 的高准确性, PD 特异性的评分标准(APS)在区分 PD 严重程度方面表现出高敏感性,实现了在早期(术后 2 周)检测到 PD ,且 APS 与已建立的神经病理学特征高度相关,显示出其作为 PD 病理行为指标的价值。此外,光遗传学工具 optoRET 通过特定的光激活计划有助于改善 PD 小鼠病理特征,通过治疗反应评估,直观地展现了 optoRET 在改善 PD 小鼠的运动功能和光谱特征的显著效果。总的来说,这项研究不仅加深了对 PD 的理解,还为未来的治疗策略提供了新的视角。

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参考文献
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Hyeon B, Shin J, Lee JH, et al. “Integrating artificial intelligence and optogenetics for Parkinson’s disease diagnosis and therapeutics in male mice.” Nature Communications. 2025;16(1):7797. Published 2025 Aug 21. doi:10.1038/s41467-025-63025-w