Nature Communications | 中科院昆明动物所石磊团队基于 AI 精细行为发现 DNA 复制速度快可致焦虑!

本研究开创性地揭示了 DNA 复制叉速度是调控大脑皮层神经发生的关键 “配速器”,它通过一个由 MCMBP 蛋白介导的 “刹车” 机制被精确控制。文章使用 一湾生命科技 BehaviorAtlas 3D-AI 动物行为分析系统 巧妙地将 DNA 复制这一分子生物学过程与神经行为学联系起来 ,揭示胚胎期复制叉速度的失控会对大脑的最终功能产生深远影响。

大脑皮层的正常发育是一个极其复杂和精确的过程,它决定了我们高级认知功能(如感觉、学习、记忆和情绪)的基础。这个过程的核心是神经干细胞(放射状胶质细胞,RGCs)的增殖和分化。每次细胞分裂,都必须完整无误地复制其全部遗传物质(DNA)。科学家们已经知道 DNA 复制的启动很重要,但对于复制叉前进的速度 (DNA fork speed)是否以及如何在皮层发育中扮演调控角色,一直知之甚少。

2025 年 11 月 18 日,中科院昆明动物研究所科研团队 (通讯作者为石磊 研究员)在 Nature Communications 发表了题为 “DNA replication fork speed Acts as a Pacer in Cortical Neurogenesis” 的研究论文。该研究揭示了 DNA 复制叉速度并不仅仅是一个被动的生化速率,而是作为一个 “配速器”,深刻地调控着神经干细胞的命运和大脑皮层的构建。最重要的是,研究将 DNA 复制这一胚胎期的分子事件与成年后的行为联系起来 ,表明无论是哪种形式的复制叉速度异常,最终都会导致成年小鼠表现出显著的焦虑样行为

01 DNA 复制叉 “异常加速” 导致的小头畸形

在大脑发育过程中,微小染色体维持蛋白(Minichromosome Maintenance Proteins, MCMs)持续高表达,通过抑制 DNA 复制叉的速度来确保 DNA 的稳健复制。在这一过程中,MCM 结合蛋白(MCMBP)对于维持 MCMs 的正常功能至关重要(图 1a)。研究表明,在大脑发育的过程中,MCMBP 逐渐减少(图 1b, c),与此相反,复制叉速度则自然加快。通过在神经前体细胞(RGCs)中敲除 Mcmbp 基因(cKO),研究人员人为地打破了这种平衡,MCMBP 的缺失导致神经祖细胞逐渐丧失(图 1h-l),进而导致 cKO 小鼠发育迟缓、小头畸形(图 1d-g),这些结果表明了 MCMBP 在大脑发育中的重要调节作用。

图 1. 神经祖细胞中 Mcmbp 的缺失导致小头畸形

更重要的是,研究发现 MCMBP 缺失显著加快了 DNA 复制叉速度 (图 2k),导致细胞广泛的 DNA 损伤反应(图 2g),从而激活了 p53 通路(图 2d-f),最终触发皮质发育过程中广泛的 p53 依赖性细胞凋亡

图 2. Mcmbp 缺失导致 DNA 损伤和 p53 激活

02 DNA 复制叉 “极端加速” 导致的大脑结构紊乱

为了进一步地验证这一机制,随后,研究人员构建了同时敲除 McmbpTrp53 的双敲除小鼠(dKO),相较于 cKO,没有 p53 的干预后,dKO 小鼠的细胞凋亡现象完全消失(图 3d-g),大脑尺寸也得到了很大程度的恢复(图 3a-c)。然而,在 dKO 小鼠中,DNA 复制叉速度变得比 cKO 小鼠中更快了 (图 3i)。

图 3. Trp53/Mcmbp 共缺失部分挽救了小头症

DNA 复制叉的极端加速也带来了更严重的问题,在 dKO 小鼠的大脑皮层中,大量的 RGCs 不再像正常那样附着在脑室(VZ)表面,而是 “脱落 ” 到了亚脑室(sub-ventricular zone, SVZ)和中间区(intermediate zone, IZ)(图 4a, c),并表现出异常的分化特性(图 4d-f)。

这些结果揭示了 p53 的一个非经典功能。它不仅在 DNA 损伤时诱导凋亡,在正常情况下还参与维持 RGCs 的黏附。当复制叉速度极端失控时(dKO),即使没有细胞凋亡,也会因为 RGCs 的 “脱锚” 而导致皮层结构紊乱

图 4. Trp53/Mcmbp 共缺失导致 rgcs 和 IPCs 的脱位

深入的机制研究表明,这种脱落与中心体功能缺陷有关。 实验发现,MCM 蛋白复合物(特别是 MCM3)可能通过与 p53 及中心体蛋白 PCNT 的相互作用,协同调控 DNA 复制和细胞的锚定(图 5)。

图 5. MCM3 在祖细胞中协调 DNA 分叉速度和中心体的生物发生

03 DNA 复制叉速度异常导致的焦虑样行为

为了研究 RGCs 中 DNA 复制叉速度异常的长期后果,研究人员对成年后的小鼠进行了行为学测试。通过 3D 小鼠行为分析系统,研究发现,无论是大脑萎缩的 cKO 小鼠,还是大脑结构紊乱的 dKO 小鼠,它们在旷场中央区域的活动时间都显著少于正常小鼠(图 6b, c),这是典型的焦虑样行为。与 Ctrl 小鼠相比,cKO 和 dKO 小鼠的自发行为模式也表现出明显异常,表现为 cKO 小鼠的理毛增加(焦虑的体现),两组均出现嗅探行为减少(图 6d)。

图 6. 复制叉速度异常出现的焦虑样行为

这些结果强烈支持一个模型,即 DNA 分叉速度作为一个细胞 “配速器”,在皮质神经发生过程中需要精确调节:

适度加速 会导致 DNA 损伤,激活 p53 “监护” 通路,从而引发大规模的神经干细胞凋亡,最终导致小头畸形。
极端加速 虽然阻止了细胞凋亡,挽救了大脑的大小,但却导致了更严重的问题:神经干细胞失去了在脑室表面的 “锚定” ,发生大规模的脱落和异位增殖。

图7

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参考文献:
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Wang, J., Kong, Y., Li, X. et al.DNA replication fork speed acts as a pacer in cortical neurogenesis. Nat Commun16**, 10121 (2025). DNA replication fork speed acts as a pacer in cortical neurogenesis | Nature Communications