科研小白也能看懂的，最前沿的，最经典的，最靠谱的动物行为学分析方法干货!包括免费工具做行为学的合集!
Image J 让动物行为学轨迹追踪超简单
ImageJ导入视频 → 启动 ImageJ → 直接拖入实验视频 → 关键设置：可勾选 Convert to Grayscale
划定分析区域 → 点击Animal Tracker 调用插件追踪动物→ 点击Set active image选择视频
随后划定分析区域
→Set Tracking Area→ 矩形工具框选活动分析的区域 → 绿色边界框自动生成
阈值范围设置
→ 点击Set threshold
→设置合适阈值 → 追踪小鼠，小鼠变成红色就可以啦
目标识别校准 → 启用 Set Blob Detector → 单击动物 → 红色检测框锁定目标
自动化追踪执行 → 运行 Start Tracking → 等进度条跑完，系统自动生成轨迹线（躺平收数据
）， 导出 txt文件，含小鼠运动的X/Y坐标
挖到动物行为分析神仙工具！ Bonsai
实操录屏Bonsai动物运动轨迹追踪操作流程！非常简单！
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免费！1 分钟上手！中央区距离自动算！绝了：
精准到帧，自动扒小鼠中心点 ，甚至是头尾
轨迹线秒画，轨迹识别超级快！
数据直接导 Excel！
中央区时间 / 路程秒出（单位任选）
不用熬大夜，摸鱼时间都多了！
科研贫穷党！谢天谢地！
Image J 玩转动物行为分析
科研党必看！
Image J 直接封神！小白友好到尖叫！实操录屏Image J 动物运动轨迹追踪操作流程！非常简单！
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看教程 1 分钟就能上手
不用复杂设备 ——
普通电脑 + 摄像头（手机支架架着拍就行）
免费软件 Image J + Animal Tracker 插件
拖视频、框区域、标动物… 几步搞定
自动画轨迹线
数据直接导出 txt文档
摸鱼时间都变多了
免费软件灵活自定义旷场中央区域附神器
视频链接：请点击
免费软件不会调整旷场中央区域？ 别急！别急！灵活自定义的教程这就来啦！详见视频！本次分析，使用的是免费软件——Bonsai，分析小鼠旷场实验的工具包~~~非常简单！跟着视频操作就会免费软件分析旷场实验啦！
免费！小鼠/鱼行为识别！黑边视频轻松应对
视频教程：请点击
鱼//小鼠/饲养笼实验都头大… 背景太乱识别不准？视频有黑边直接卡壳， 找了一圈工具不是收费就是适配性差，直到挖到这个免费神器！ 做动物行为学的宝子别错过
单相机录制4旷场的免费分析工具！DIY教程
视频教程：请点击
闭眼入！想DIY自己玩转行为学！单相机 + 免费工具 = 4 旷场分析，经费紧课题组必看！
免费丨旷场全参数丨中央时间/路程/XY坐标
视频教程：请点击
谁懂做旷场实验的痛！付费软件贵还不好用 最近发现一款免费软件太香了！XY 坐标、中央区域时间、路程这些关键参数全能测！ 不用复杂设置，导入视频到Bonsai能出结果，省了买付费软件的钱！
搞定核心参数：
XY 坐标
中央区域时间
路程
步骤超简单：导入实验素材→简单校准→一键生成数据
免费软件分析旷场Y迷宫丨时间.路程.XY坐标
视频教程：请点击
旷场实验封神！免费软件 Bonsai 零基础 10 分钟出全参数
谁懂啊家人们！做动物行为学实验真的离不开数据分析
商业软件动辄大几千，新手还得学半天，结果参数还不全…直到挖到 Bonsai 这个开源神器！免费 + 零基础 + 全参数输出，科研党直接狂喜！
核心亮点直接戳中痛点：
完全免费！无套路开源，省出经费买试剂
全参数覆盖：中央时间 / 中央路程 / XY 坐标 / 轨迹热图全都有
零基础友好：界面简洁，不用写代码，拖拖拽拽就搞定
数据可导出：CSV 格式直接对接 Excel/GraphPad，作图不费劲
1 个赞
DIY小鼠实时闭环刺激丨声音/蜂鸣/灯光刺激
视频教程：请点击
手把手教大家一步步DIY小鼠实时闭环刺激：
小鼠进入目标区域→自动触发声音 / 蜂鸣刺激
离开区域→刺激立即停止
声音 / 灯光刺激可自定义，实时闭环超精准！
我将系统比较3种技术
细节缺失、易干扰、难识别具体动作
AI 动物行为分析，降维打击！
还在人工记录动物行为？out 啦！今天给大家科普科研党超爱的 AI 姿态估计技术，让实验效率直接翻倍！
什么是 AI 姿态估计？
简单说，就是让 AI 当 “超级观察员”！它能自动识别动物的耳朵、爪子、尾巴等关键点，精准记录跑跳、站立等动作，还能把这些动作转化成数据。
BehaviorAtlas
这是广东一湾生命科技有限公司的 2D-AI 动物行为分析系统。它基于强大的 2D-AI 算法体系，还能兼容 DeepLabCut 模型，识别动物行为的精确性很有保障。而且，它支持加载由一湾生命 Pose labeler 软件训练的模型，借助深度学习算法对动物进行精准追踪，为动物行为研究提供可靠又高效的技术支持。
给大家附上相关信息：www.bayonesci.com
DeepLabCut（DLC）
这是基于深度学习的工具，也是很多科研人员的心头好。
它有个厉害之处是基于迁移学习，不用大规模标注就能快速训练。而且适用范围广，支持多种物种，像小鼠、斑马鱼、果蝇等都能识别，还能处理多视角视频。
另外，它配套了 GUI 和 Python API，不管是实时分析还是离线分析都很方便。
给大家附上相关信息：
文档: https://deeplabcut.github.io/DeepLabCut/README.html
安装: pip install 'deeplabcut [gui,tf]'
模型库: http://modelzoo.deeplabcut.org
∞免费在线课程: Learning to use DeepLabCut | Genially
首页: 有了这些工具，动物行为研究是不是轻松多啦？赶紧码住试试！
咨询一下，我的AVI视频不能导入到Image J分析是为什么？
还想问下，如何这个不能用，有什么其他的替代方法吗？
我测试了一下个别的的AVI视频，发现确实不能打开，这里我解释一下原理和解决办法供你参考呀～主要是因为视频格式的原因
首先 Image J 是默认自带 AVI Reader的，图片中介绍了它只支持几种少的格式，支持未压缩的 AVI 或者 MJPG ～
那么如何解决呢？
安装 FFmpeg 工具（需要一些代码背景）或其他视频转换工具，把不能导入 的视频使用工具转为 MJPG 视频编码的 AVI 就可以导入了，我也测试过了原来不能导入的视频，转了是可以的！
使用ImageJ插件支持更多格式，需要安装 FFMPEG 到 ImageJ，这个我在网上找了很多个教程，都没尝试成功
，如果友友尝试成功了可以教教我呀～
另外，imageJ 失败了，你可以用我分享的Bosai，比较简单容易上手，可以看我前面的教程