Nat Commun丨AI 解码自发行为:CLOSER 框架实现抑郁小鼠行为的“定制化”检测

传统抑郁行为检测与人类症状严重脱节。 Won Do Heo 团队开发 CLOSER 框架,利用 3D 骨架和对比学习,将小鼠自发行为分解为 50 个行为音节。发现慢性应激雄性改变 12 个音节频率(雌性 6 个),随机森林分类器诊断准确率雄性 88%(基于转移概率)。时间进程分析显示第 3 周行为偏离最大;异常检测证实应激改变行为结构而非产生异常动作。药物筛选中,CLOSER 区分了单胺类与非单胺类抗抑郁药的不同行为指纹。

上述研究中使用的 CLOSER 为自研算法,需要较高编程和深度学习能力。而一湾生命科技自主研发的 BehaviorAtlas 3D-AI 精细行为学分析系统,提供更便捷、一体化、本土化的解决方案,无需编程能力,即可支持上述高精度行为学研究。

抑郁症动物模型传统依赖悬尾、强迫游泳和糖水偏爱测试,但这些方法过度简化,与人类自发行为脱节。 韩国科学技术院 Won Do Heo 团队在 Nature Communications 发表研究,研究开发了 CLOSER(基于对比学习的自发行为无观察者分析平台),利用五相机 AVATAR 系统重建小鼠 3D 骨架(9 个关键点,30 帧/秒),通过数据增强和时空图卷积网络进行自监督对比学习,将行为分解为 50 个音节,再通过多数投票进行时序分割。

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CLOSER 行为音节识别性能优于现有方法

研究对比了 CLOSER 与 VAME、Keypoint-MoSeq。CLOSER 识别的行为片段平均持续 590 ms,接近人工标注(959 ms),而 VAME 过短(258 ms)。k 近邻分类器中,CLOSER 的平衡准确率达 66%,高于其他方法(图 1c)。UMAP 降维显示不同行为音节(行走、转向、直立、下落)在嵌入空间中形成清晰分离的簇,且每种行为的运动学特征(移动距离、头-体角度、鼻子高度)与预期一致(图 1f-i)。CLOSER 对小鼠体重信息的预测准确率最低,证明其通过缩放增强实现了大小不变性。

图 1. CLOSER 框架识别了将行为片段分类为语义音节的时间和行为特征

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慢性不可预测应激(CUS)诱导性别特异性行为结构改变

雄性 CUS 小鼠在悬尾和强迫游泳中不动时间均增加,雌性仅在强迫游泳中增加(图 2a-b)。开放场中,CLOSER 将 20 分钟记录分为 4 个 5 分钟段,计算音节频率和转移概率。

线性判别分析显示,CUS 雄性和雌性的音节频率明显分离,而转移概率趋同(图 2g)。随机森林分类器利用转移信息对雄性应激的预测准确率达 88%,雌性为 70%(图 2h)。

雄性 CUS 有 12 个音节频率显著改变(如理毛增加、行走和直立减少),雌性仅 6 个(图 2i)。时间分箱显示多数差异出现在第 3-4 个 5 分钟,表明应激效应需充分暴露后才显现(图 2j-k)。转移网络图显示 CUS 显著改变了行为间的转换概率(图 2l)。

图 2. 慢性不可预测压力以性别依赖的方式改变探索行为的结构

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CLOSER 追踪抑郁样行为的时间进程

每周记录 CUS 小鼠 20 分钟行为。随机森林分类器不仅能区分应激与对照,还能识别应激持续时间(图 3a-b)。

LDA 显示 LDA1 轴分离应激状态,LDA2 轴分离应激时长(图 3c-d)。第 3 周行为频率差异最大,分类器准确率达峰值(图 3e,h)。

SHAP 分析显示,区分第 3 周 CUS 的关键音节包括“站立”(增加)、“静止(高鼻)”(增加)、“旋转”(减少)、“背部理毛”(减少)和“嗅闻”(减少)(图 3f-g)。

第 4 周差异减小,提示环境适应。转移网络显示 3 周应激显著改变了行为转换结构(图 3i)。

图 3. 随着抑郁样行为致病机制的进展,自发行为的异源性变化

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CLOSER 区分不同抗抑郁药的靶点与脱靶效应

在 CUS 雄性小鼠中给予单胺类(氟西汀、丙咪嗪)或非单胺类(胍丁胺、东莨菪碱、雷帕斯汀)抗抑郁药。

随机森林分类器基于音节频率和转移,灵敏度约 50%,特异度约 90%(图 4b)。CUS 导致 4 个行为簇(31,12,49,28)频率改变,簇 31 被所有药物恢复,其他选择性恢复(图 4c-d)。

非单胺类药物脱靶效应更多。SHAP 分析发现,“直立”增加是非单胺类药物的行为指纹(图 4e)。转移图显示单胺类药物对行为语法恢复有限(图 4f)。

雌性 CUS 中行为指纹以头部运动和嗅闻为主,脱靶效应更明显。这些结果表明 CLOSER 可量化抗抑郁药的个体化行为效应。

图 4. 机器学习引导发现抗抑郁药个体性在小鼠探索行为中表现出来

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总结

CLOSER 通过自监督对比学习,从小鼠自发行为的音节频率和转移概率中,高准确率识别 CUS 应激(雄性 88%),揭示抑郁行为的性别二态性、时间进程,并区分不同抗抑郁药的靶点恢复与脱靶效应,为精神疾病的客观诊断和药物筛选提供了新工具。

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BayOne 产品介绍

上述研究中使用的 CLOSER 为自研算法,需要较高编程和深度学习能力。而一湾生命科技自主研发的 BehaviorAtlas 3D-AI 小鼠精细行为分析系统,采用全自动无监督聚类,无需人工标注,即可将自发行为分解为 40+种行为亚型。系统支持 3D 骨架重建(16 个关键点)、UMAP 降维可视化、多种范式兼容、开箱即用,无需编程。

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目前,BehaviorAtlas 3D-AI 动物行为分析系统已经在大、小鼠、非人灵长类动物、犬类等模式动物上,针对自闭症、帕金森症、抑郁症、脑出血等疾病模型以及精神类药物筛选上进行了多种应用。

在此,我们也感谢 BehaviorAtlas 的用户对我们系统的关注和支持,希望 BehaviorAtlas 能够帮助更多的科研人员去解答生命科学中的难题。

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参考文献:

Oh H, Choi S, Lee J, et al. AI-driven decoding of naturalistic behaviors enables tailored detection of depressive-like behavior in mice. Nat Commun . 2025;17(1):851. Published 2025 Dec 30. doi:10.1038/s41467-025-67559-x